ลำดับจีโนมในปัจจุบันสะสมอย่างรวดเร็วจนภายใน
เวลาเว็บสล็อตไม่ถึงหนึ่งสัปดาห์ ห้องปฏิบัติการเดียวสามารถสร้างบิตของข้อมูลได้มากกว่าที่เช็คสเปียร์จัดการตลอดช่วงชีวิต แม้ว่าอย่างหลังจะอ่านได้ดีกว่าก็ตาม ด้วยข้อมูลที่ท่วมท้นความต้องการความเข้าใจในโครงสร้างสามมิติและหน้าที่ของโปรตีนที่เข้ารหัสโดยยีนเหล่านี้ แต่ในขณะที่การจัดลำดับยีนเป็นเรื่องง่าย การระบุหน้าที่ของผลิตภัณฑ์ยีนหรือกลไกการทำงานของยีนนั้นไม่ใช่เรื่องง่าย
สองวิชาที่ดูเหมือนไม่เกี่ยวข้องกัน — การพับโปรตีนและเอ็นไซม์วิทยา — เป็นหนึ่งในสาขาวิชาที่ถูกเกณฑ์ให้ช่วยในงานอันยิ่งใหญ่นี้: วิชาแรกด้วยความหวังว่าในที่สุดเราจะสามารถสรุปโครงสร้างของโปรตีนจากลำดับของมันเพียงอย่างเดียว อย่างหลังเพราะมันพยายามอธิบายว่าเอ็นไซม์ทำงานอย่างไรโดยผสมผสานเคมีอินทรีย์และอนินทรีย์เข้ากับโครงสร้างโปรตีน ในหนังสือเล่มนี้ หนึ่งในผู้ปฏิบัติงานชั้นนำของทั้งสองสาขาได้กำหนดหลักการทางกายภาพและเคมีที่ควบคุมการพับของโปรตีนและการทำงานของเอนไซม์ในบทสรุปของการตรวจสอบอย่างเข้มข้นกว่า 20 ปี
การรักษาทั้งตัวเร่งปฏิกิริยาของเอนไซม์และการพับโปรตีนมักจะเป็นข้อความที่มีผู้เขียนหลายคน แก้ไขโดยผู้เชี่ยวชาญอย่างน้อยหนึ่งคนจากแต่ละสาขา แต่ Alan Fersht เป็นผู้บุกเบิกในทั้งสองด้าน ทำให้หนังสือเล่มนี้มีมุมมองที่ไม่เหมือนใครและสอดคล้องกัน แม้ว่าจะมีชื่อใหม่และเนื้อหาใหม่มากมาย แต่หนังสือเล่มนี้เป็นการปรับปรุงและขยายข้อความคลาสสิกของผู้เขียน โครงสร้างและกลไกของเอนไซม์ (W. H. Freeman, 1985) นี่เป็นข้อดี เนื่องจากหนังสือเล่มนั้นเป็นแบบจำลองของการอธิบายที่ชัดเจนและรัดกุม และวัสดุดั้งเดิมส่วนใหญ่ได้รับการเก็บรักษาไว้ โดยเฉพาะอย่างยิ่งในบทที่เกี่ยวกับตัวเร่งปฏิกิริยาทางเคมีและอัตราการเกิดปฏิกิริยาของเอนไซม์ ทว่าในช่วง 14 ปีนับตั้งแต่ตีพิมพ์หนังสือเล่มล่าสุด มีการระเบิดข้อมูลเกี่ยวกับโครงสร้างโปรตีนและความสัมพันธ์กับหน้าที่การทำงาน ซึ่งส่วนใหญ่ขับเคลื่อนโดยผลึกเอ็กซ์เรย์ เรโซแนนซ์แม่เหล็กนิวเคลียร์ และวิศวกรรมโปรตีน
ค่อนข้างถูกต้อง Fersht เริ่มต้นด้วยโครงสร้างโปรตีน
เขาทบทวนสิ่งที่ทราบเกี่ยวกับโดเมนโปรตีนและระดับองค์กรที่สูงขึ้น ไม่ใช่สารานุกรม แต่ด้วยตัวอย่างที่เลือก แม้ว่าฉันจะเลือกตัวอย่างที่แตกต่างกันในบางกรณี แต่สิ่งเหล่านี้ส่วนใหญ่ตอบสนองวัตถุประสงค์ได้ดี บทเกี่ยวกับสารยับยั้งที่ควบคุมโดยการใช้สารออกฤทธิ์นั้นยอดเยี่ยมจากมุมมองทางเคมี แต่อาจได้รับประโยชน์จากตัวอย่างเพิ่มเติมของโครงสร้าง ตัวอย่างเช่น ในการอภิปรายเกี่ยวกับสารยับยั้งของเอนไซม์ที่เชื่อมโยงกับไพริดอกซอลฟอสเฟต ภาพประกอบคือไวนิลไกลซีนและβ-คลอโรอะลานีน ซึ่งเป็นกลไกที่ยังไม่มีการสร้างที่ชัดเจน แทนที่จะเป็นไซโคลเซอรีนซึ่งเป็นกลไกเหล่านี้
แม้ว่าหัวข้อที่สำคัญของเอนไซม์ allosteric, สวิตช์ระดับโมเลกุล และโปรตีนจากมอเตอร์จะไม่สามารถครอบคลุมได้ลึกมากในหนังสือเกี่ยวกับขอบเขตที่ครอบคลุมนี้ หลักการทั่วไปได้อธิบายไว้อย่างชัดเจนและตัวอย่างที่ใช้ก็ยอดเยี่ยม ในทำนองเดียวกัน ในการอภิปรายเรื่องการใช้พลังงานผูกมัดในการเร่งปฏิกิริยา ซึ่งมักจะเป็นหัวข้อที่สับสน — Fersht บรรลุความชัดเจนที่น่าชื่นชม ในส่วนใหม่ เขาได้นำเสนอกรณีศึกษาจำนวนหนึ่งในด้านวิศวกรรมโปรตีน โครงสร้างและกลไกของเอนไซม์
หนังสือเล่มนี้ลงท้ายด้วยบทใหม่สามบทที่อธิบายผลการศึกษาวิศวกรรมโปรตีนเกี่ยวกับพลังงานของโครงสร้างโปรตีน และวิถีทางที่โปรตีนบางตัวที่เลือกจะพับ นี่คือการรักษาที่ดีที่สุดที่ฉันได้อ่านจากหัวข้อสำคัญนี้ น่าเสียดายที่หลักฐานแสดงให้เห็นว่าไม่มีกลไกสากลสำหรับการพับโปรตีน ซึ่งมักจะทำการศึกษารายละเอียดเกี่ยวกับการพับของโปรตีน sui generis ทุกรายละเอียด Fersht ไม่ได้แก้ปัญหานี้ แต่ดูเหมือนว่าการศึกษาเส้นทางพับของโปรตีนแต่ละตัวไม่น่าจะช่วยแก้ปัญหาในการเปลี่ยนจากลำดับของโปรตีนไปเป็นโครงสร้างของโปรตีน วิธีการคำนวณอย่างหมดจดและการเปรียบเทียบกับลำดับและโครงสร้างอื่นๆ (‘การพับแบบผกผัน’) ยังคงเป็นความหวังที่ดีที่สุดสำหรับวิธีแก้ปัญหาในทางปฏิบัติ
ส่วนใหญ่ของหนังสือเล่มนี้ โดยเฉพาะอย่างยิ่งในสองสามบทสุดท้าย เป็นการอภิปรายเกี่ยวกับงานของผู้แต่งเอง แต่ด้วยความสำเร็จของเขา ไม่มีหนังสือเกี่ยวกับกลไกกลไกหรือการพับโปรตีนใดที่สามารถกล่าวได้ว่าครอบคลุมโดยปราศจากการอภิปรายดังกล่าว ใครก็ตามที่พยายามทำ functional genomics จะพบว่าหนังสือเล่มนี้มีค่ามาก ไม่เพียงแต่เป็นแหล่งตัวอย่างของการศึกษาเชิงฟังก์ชันอย่างละเอียดถี่ถ้วนเท่านั้น แต่ยังเป็นแนวทางในหลักการพื้นฐานของวิธีการทำงานของโปรตีนด้วย
การร้องเรียนหนึ่งครั้ง: สำเนาของฉันมีการอ้างอิงจำนวนหนึ่งที่ไม่ตรงกับการอ้างอิงในข้อความ และในฉบับต่อไป น่าจะมีหัวข้อเกี่ยวกับทรัพยากรบนเว็บสำหรับโครงสร้างโปรตีน ชีววิทยาระดับโมเลกุล และชีวเคมี ข้อความที่ทันสมัยต้องการพวกเขาเว็บสล็อต
